2003年初上海闸北区体育局下属的精文足球学校不少学员即将毕业于是闸北区体育局决定以精文足球学校的学员为班底组建俱乐部参加当年的全国足球乙级联赛以解决学员的出路问题。在副局长边海宝的运作下与闸北区国资企业上海金贸资产管理公司董事长傅伟民达成共识由金贸出资、精文出人、闸北体育场提供场地共同组建了上海金贸足球俱乐部。但在联赛开赛前上海金贸接到上级主管单位的指示从俱乐部控股位置退出。上海衡源企业发展有限公司及时接手了俱乐部形成了上海衡源控股上海金贸、闸北体育局、闸北体育场为股东的新俱乐部——上海衡源足球俱乐部确保了球队能顺利参加联赛。
 
        2003年底在闸北区体育局的引荐下上海衡源足球俱乐部与南昌市体育局有了接触。     2004年初上海衡源足球俱乐部出资买下解放军八一青年队并将主场移至南昌八一体育场。         2011年亚足联对中超各俱乐部赛场进行第二次复查时南昌八一体育场与首次检查时一样未能通过审核;此外闸北区在上海世博会召开前拆除了闸北体育场。

         2012年初上海衡源足球俱乐部考察了上海金山足球场、源深体育中心体育场和江西省奥林匹克体育中心后;综合考虑俱乐部决定将新赛季主场将放在上海金山足球场训练基地则放在位于奉贤的洪庙基地;此外球队名也更名为上海申鑫足球队。